Senotype Blueprint of the Human Endocrine Pancreas
ADA2026

Senotype Blueprint of the Human Endocrine Pancreas

2026-06-05

Senotype Blueprint of the Human Endocrine Pancreas(人類內分泌胰臟的衰老表型藍圖)

場次開場與研究主題定位

本場次屬於 Human Islet Identity and Organization 主題,聚焦人類胰島(human islet)的細胞身分、組織架構與功能調控。場次由 Mount Sinai Diabetes Institute 的 Ezra Carricos 主持,共安排四場短講,每場約 10 分鐘,之後保留約 5 分鐘問答;問題集中在各講結束後由聽眾至麥克風前自我介紹後提問。

第一場演講由 Cristina Aguayo-Mazzucato 報告,題目為 Senotype Blueprint of the Human Endocrine Pancreas。這項工作主要由實驗室博士後 Kanako Iwasaki 主導;因其無法到場,Cristina Aguayo-Mazzucato 代表團隊分享研究成果。核心訊息是:在人類成人生命歷程中的內分泌胰臟,至少存在兩類具有不同生物意義的 senotypes(衰老表型)

報告者揭露利益關係:Cristina Aguayo-Mazzucato 擔任 Novo Nordisk 與 Sanofi 顧問。此研究來自 Joslin Diabetes Center / Harvard Medical School affiliate 的 Beta Cell Aging Lab,並屬於 Senescence Tissue Mapping Center 相關工作;此場為 ADA 2026 1028-OR 報告。

本演講的邏輯分成四個層次:

  1. 先回顧 cellular senescence(細胞衰老) 的基本概念,以及它與第二型糖尿病(type 2 diabetes, T2D)的關聯。
  2. 說明 SenNet(Cellular Senescence Network) 針對健康老化過程中衰老細胞定位與特徵建立的努力。
  3. 引入 senotype 的概念:衰老細胞不是單一狀態,而是可依照 transcriptome、spatial interactome 與功能後果分為不同族群。
  4. 最後提出目前的工作模型:p16/CDKN2A 相關衰老表型可能偏向適應性、生理性;p21/CDKN1A 相關衰老表型則可能偏向失適應性、病理性。

細胞衰老:停止分裂但不死亡,並透過 SASP 影響周邊環境

Cellular senescence 是一種壓力反應。衰老細胞進入相對穩定、持久的 cell-cycle arrest(細胞週期停滯) 狀態:它們停止分裂,但並不立即死亡。這些細胞同時具有典型的 pro-inflammatory senescent phenotype,也就是會分泌一組可影響鄰近細胞的因子,稱為 senescence-associated secretory phenotype(SASP)

衰老細胞有幾個重要特徵。第一,它們在組織中通常屬於少數族群,比例不高;第二,它們非常異質,會因細胞類型、組織位置、誘發壓力與生理狀態不同而呈現不同標記與功能。這種異質性是目前領域中最重要也最困難的問題之一:我們仍不完全知道是什麼因素決定衰老細胞的不同狀態,更不清楚不同狀態在生理或病理上究竟具有何種意義。

從胰島 β 細胞與糖尿病的角度來看,Aguayo-Mazzucato 團隊過去已經指出,β-cell senescence 是推動第二型糖尿病的重要現象之一。近期研究更顯示,在小鼠與人類中,一群表現 p21(CDKN1A) 的衰老 β 細胞會在第二型糖尿病進展早期出現,甚至可視為疾病進展前的關鍵亞群。

相關背景資料指出,p21 陽性 β 細胞亞群在 T2D 進展早期出現的研究由 Iwasaki K 與 Carapeto P 等發表於 JCI Insight(in press)。

然而,細胞衰老並非全然有害。衰老細胞在 tumor suppression(腫瘤抑制)wound healing(傷口癒合) 中有重要的保護作用。問題在於,當衰老細胞隨年齡累積,特別是在慢性代謝疾病背景中,它們可能促進多種 age-associated conditions,包括糖尿病。動物研究中,清除衰老細胞與改善健康壽命(healthspan)及壽命(lifespan)相關;因此若未來要將這類策略轉譯至臨床,必須先理解「哪些衰老細胞需要被保留、哪些可能需要被靶向清除」。

細胞衰老的 hallmarks 包括:p53、p16INK4A/CDKN2A、RB、MKI67、p21CIP1/CDKN1A 等 cell-cycle arrest 相關路徑;DNA damage response(DDR)與 γH2AX、T53BP1;核內 HMGB1 loss、lamin B1 loss、SAHF、SADS/TAF 等 nuclear changes;抗凋亡路徑如 ABL1、BCL2L1、EFNB1、SERPINB2;SASP 與發炎因子如 IL-6、GDF15、IL-1α、TGFB1、IL-1β、IFNγ;細胞表面標記如 uPAR、NOTCH3、DPP4、CD36、NOTCH1、TNFRSF10D、ICAM1、oxidized vimentin;以及 ROS、粒線體與 lysosomal content 增加、SA-β-galactosidase 活性升高、細胞形態改變等。

這些特徵不會在每個衰老細胞中同時出現。不同細胞可能只呈現部分 hallmarks,導致衰老細胞在組織內與跨組織之間都高度異質。這也使得不同研究在不同組織、甚至同一組織內得到的結果難以互相整合:一個研究用 p16 定義衰老細胞,另一個研究用 p21 或 SA-β-gal,看到的可能其實是不同衰老狀態。

跨組織異質性的例子包括:神經元可呈現 low LMNB1、lipofuscin、high p21;小膠質細胞可呈現 high p16、SASP、SA-β-gal;肺泡上皮細胞偏 high p21 與 DNA/lipid damage;肝細胞可出現 DNA/oxidative damage 與 ALISE;脂肪細胞常見 high p21、high p53、SA-β-gal;皮膚 fibroblasts 偏 high p16、SASP、SA-β-gal;骨細胞可同時 high p21 與 p16。這些資料呼應 Ogrodnik M et al., Cell 2024 對衰老標記異質性的整理。

SenNet 與 KAPP-Sen:在人類生命歷程中建立衰老細胞地圖

為了解決衰老異質性與臨床轉譯問題,SenNet(Cellular Senescence Network) 的目標是建立高品質的人類衰老細胞地圖,描繪不同器官中衰老細胞的位置、分子特徵與組織互動。Aguayo-Mazzucato 團隊參與的是針對 kidney、adipose tissue、pancreas、placenta 的組織繪圖中心,簡稱 KAPP-Sen;其中 Joslin 團隊主要負責胰臟與胰島相關分析。

KAPP-Sen 的目標是讓 SenNet 能在人類生命歷程中建立 kidney、adipose tissues、pancreas 與 placenta 的 senescent cell maps。設計上納入不同年齡層:年齡 <35 歲、35≤年齡<60 歲、以及 ≥60 歲;排除條件包括 diabetes mellitus、BMI >30、pancreatitis、pancreatic cancer 或 metastasis。

本研究使用兩類人類胰臟材料:

  1. Whole pancreas(全胰臟組織)
    組織在 Joslin 處理後,再送至 Jackson Laboratory 進一步進行空間蛋白體與空間轉錄體分析。研究者會從胰臟不同區域取樣,以提高整體代表性。

  2. Dispersed pancreas / dispersed islets(分散胰臟或分散胰島樣本)
    這些樣本用於 single-cell RNA-seq,並在 Joslin 進行功能測試與染色分析,包括 insulin secretion 功能評估以及衰老相關標記檢測。

Whole pancreas cohort 約 n=26,dispersed pancreas/islets cohort 約 n=14。兩個 cohort 在年齡上大致可比,但 dispersed islet cohort 的 BMI 顯著較高。Whole pancreas cohort 年齡範圍約 21–82 歲,平均約 50.7±18.4 歲,BMI 約 23.7±4.0,性別約女性 50%、男性 50%;dispersed islets cohort 年齡約 34–69 歲,平均約 55.1±8.6 歲,BMI 約 27.5±3.1,女性約 29%、男性約 71%;BMI 差異 p=0.005。

研究平台包括 spatial proteomics、spatial transcriptomics 與 single-cell transcriptomics:

  • CODEX:用抗體影像方式測量蛋白質,具單細胞解析度。
  • Visium:以 barcoded transcript capture 做空間轉錄體,解析度較低,每個 spot 可含多個細胞,但能涵蓋較大片組織,適合觀察不同細胞型之間的空間關係。
  • Xenium:RNA in situ hybridization imaging,可在單細胞解析度下測量選定基因。
  • scRNA-seq:以 droplet-based 10x Genomics 平台進行單細胞 RNA 定序,可取得大量細胞的 transcriptome。

CODEX 主要偵測 proteins,解析度約 single-cell、0.25 μm/pixel,抗體 panel 約百種;Visium 偵測 RNA,spot 約 55 μm,可涵蓋約 20,000 genes;Xenium 偵測 RNA in situ,single-cell、約 0.21 μm/pixel,可測 100–1,000 genes;scRNA-seq 為 droplet-based single-cell 方法,每個樣本可分析約 1,000–100,000 cells。依平台不同,donor/sample 數約為 CODEX 13/32、Visium 10/40、Xenium 15/32、scRNA-seq 13/42,並以多區域取樣提高代表性。

Senotype 的操作性定義:以 CDKN1A/p21 與 CDKN2A/p16 區分衰老 β 細胞族群

本研究將 senotype 定義為:具有不同 transcriptome、spatial interactome 與特徵性功能後果的衰老細胞族群。也就是說,senescence 不只是「有或沒有」的二分狀態,而可被進一步分成不同類型,每一類可能對細胞身分、功能與組織微環境造成不同影響。

研究者選擇 CDKN1ACDKN2A 作為 senotype identification 的核心依據。CDKN1A 編碼 p21CIP1,CDKN2A 編碼 p16INK4A。選擇這兩個標記有三個原因:

  1. p21 與 p16 都是衰老細胞中已知且重要的 markers 與 effectors。
  2. 在本研究使用的所有平台中,CDKN1A 與 CDKN2A 都能在胰臟不同細胞型中被偵測到。
  3. 兩者在空間與細胞群上的分布呈現離散性,暗示它們可能代表特定衰老身分,而不只是隨機或連續的表現變化。

依照 CDKN1A 與 CDKN2A 表現,研究者將人類內分泌胰臟中的衰老細胞分為三個操作性族群:

  • CDKN1A+/CDKN2A−:p21+ senotype
  • CDKN1A−/CDKN2A+:p16+ senotype
  • CDKN1A+/CDKN2A+:double-positive senotype

在 UMAP 與空間資料中,這三類 senotype 可於 Visium、Xenium、CODEX 與 scRNA-seq 等平台中被對應出來,作為 transcriptomic、spatial 與 proteomic 層次整合分析的基礎。

老化相關變化:β 細胞比例、insulin/C-peptide 下降,CDKN1A/CDKN2A 與胰島形態不規則性上升

在 whole pancreas analysis 中,研究團隊整合多個變數來看哪些特徵與年齡最相關。結果顯示,年齡上升與幾項變化呈現顯著關聯:

  • β 細胞比例下降
  • insulin 與 C-peptide 蛋白表現下降
  • CDKN1A/p21 與 CDKN2A/p16 表現上升
  • 胰島形態 eccentricity 上升,也就是胰島隨年齡變得較不圓、形態更不規則

這些結果支持一個重要概念:在人類胰臟老化過程中,β-cell senescence 是關鍵特徵之一,而且同時伴隨 β 細胞身分與胰島結構的改變。

全胰臟資料中,年齡與 endocrine β cell proportion 呈負相關(r=-0.76,p=0.001);與 CODEX insulin 呈負相關(r=-0.66,p=0.014);與 CODEX C-peptide 呈負相關(r=-0.62,p=0.025)。相反地,年齡與 Xenium CDKN1A/p21 呈正相關(r=0.72,p=0.003),與 Xenium CDKN2A/p16 呈正相關(r=0.71,p=0.003),也與 islet eccentricity 呈正相關(r=0.59,p=0.021)。

p21+ β 細胞出現明顯 β 細胞身分喪失;p16+ 與雙陽性族群則不同

確認 p21、p16 與 double-positive 三個族群後,研究者先檢查這些細胞是否也調控其他已知衰老標記,以確定它們是 bona fide senescent cells。接著研究焦點轉向 β-cell identity(β 細胞身分)

最關鍵的發現是:p21+ β cells 出現顯著 β 細胞基因下調,而這種變化並不明顯出現在 p16+ cells 或 double-positive cells。換句話說,並非所有 senescent β cells 都等同於「去分化」或「喪失功能身分」;p21+ senotype 對 β 細胞身分的負面影響特別明顯。

在 spatial proteomics 與 spatial transcriptomics 中也看到一致結果:具有高 nuclear p21 的 β cells,其 insulin 與 C-peptide 蛋白明顯較低;在 mRNA 層次,INS 與 MAFA 也下降。

CDKN1A+ senotype 的 β-cell identity loss 牽涉多個層次。分析包含 senescence-related genes / markers,如 CDKN1A、CDKN2A、TP53、RB1、TP53BP1、LMNB1;抗凋亡與壓力路徑如 BCL2L1、ABL1、EFNB1;SASP 相關 GDF15、TGFB1;表面標記如 NOTCH1、NOTCH3、CD36、ICAM1、PLAUR、TM4SF1。β 細胞身分與功能相關基因則包括 MAFA、MAFB、FOXA2、PDX1、INS、CPE、ABCC8、G6PC2、GCK/GK、GLUD1 等。空間蛋白體資料顯示 p21+ β cells 的 INSULIN 與 C-PEPTIDE Z-score 顯著下降;空間轉錄體資料顯示 INSULIN mRNA 與 MAFA 顯著下降。

這一點非常重要,因為它將 p21+ senotype 與 β 細胞功能性衰退連結起來,也為後續功能實驗奠定基礎。

功能測試:CDKN1A 高表現胰島失去 glucose responsiveness;CDKN2A 高表現胰島保留功能

接下來研究者以功能性實驗檢驗不同 senotype 是否真的對胰島功能造成不同後果。做法是依照 donor 的 CDKN1A 或 CDKN2A 表現高低將胰島分組,再比較 glucose-stimulated insulin secretion(GSIS)與 perifusion 反應。

CDKN1A 分組時,結果非常清楚:
CDKN1A 低表現 donor 的胰島對葡萄糖有反應;CDKN1A 高表現 donor 的胰島則失去 glucose responsiveness。
這在 static GSIS 與 perifusion data 中都能看到。

CDKN2A/p16 分組時,結果剛好不同:
CDKN2A 高表現的胰島保留功能,並在 perifusion 中呈現較好的反應。
這與既有研究相符:p16 過度表現曾被報告可改善 β 細胞身分與 β 細胞功能。

功能分析使用 dispersed islets,並依 scRNA-seq 中 CDKN1A 或 CDKN2A 表現值分成 High/Low 類別。Static GSIS 比較低糖 2.8 mM glucose 與高糖 16.8 mM glucose 下 insulin secretion(mU/mg DNA)。Perifusion protocol 包含 2.6 mM glucose baseline、16.8 mM glucose stimulation、回到 2.6 mM glucose,以及 IBMX challenge,總時間約至 148 分鐘。CDKN1A-high donor 約 n=4,CDKN2A-high donor 約 n=3;CDKN2A-high static GSIS 在高糖刺激下呈現功能保留趨勢(p=0.09),perifusion 結果亦支持 p16-high 族群較具功能性。

因此,p21 與 p16 雖然都是 senescence markers,但在 β 細胞中代表的生物狀態並不相同。p21+ senotype 與 β-cell identity loss、功能失調連結較強;p16+ senotype 則與保留 β 細胞身分與功能較一致。

Senotype-specific SASP:p21+ 與 double-positive 族群較具促發炎特徵,並伴隨免疫浸潤

研究下一步是釐清:不同 senotype 是否分泌不同的 SASP?若 p21+ 與 p16+ β cells 不只是 marker 不同,而是具有不同 secretome,那麼它們對周邊組織微環境的影響也可能完全不同。

研究者將過去已發表的人類胰島 SASP proteomics 資料,與本研究 donor 的 single-cell RNA-seq 資料交叉比對。結果顯示,SASP 蛋白並不是由所有 senescent population 共同轉錄或共同貢獻;不同 senotype 確實具有不同 SASP signature。

SASP 分析使用既有資料集 GSE162521:healthy human islets(donor n=6)經 FACS 依 β-gal activity 分選後培養,收集 conditioned medium(CM)進行 proteomics。此資料再與 SenNet project 中 healthy human islets 的 scRNA-seq(donor n=13)交叉比對;分析時先抽取 β-cells,再計算 CDKN1A+/CDKN2A−、CDKN1A−/CDKN2A+、CDKN1A+/CDKN2A+ 三種 pancreatic β-cell senotype scores,並比較各自 top genes 與 SASP proteomics 的對應。

Pathway enrichment analysis 顯示:

  • CDKN1A+ cells 與 double-positive cells 的 SASP 更偏 pro-inflammatory。
  • CDKN2A+ cells 的 SASP 則較不具強烈發炎特徵。

功能性讀出也與此一致:表現 CDKN1A 的胰島有較高的 immune infiltration;相比之下,CDKN2A 相關 senotype 的免疫浸潤較低。

CDKN1A+/CDKN2A− senotype 富集於 regulation of response to stress、regulation of immune system process、cytokine signaling in immune system、response to oxygen-containing compound 等路徑。CDKN1A−/CDKN2A+ senotype 則較偏 cell-cell adhesion、signaling receptor regulator activity、molecular function activator activity、regulation of cell differentiation 等。Double-positive senotype 則包含 tube development / morphogenesis、cytokine signaling、signaling by interleukins、regulation of programmed cell death 等路徑。Visium RNA 資料中,CDKN1A+ senescent cell proportion 與 immune cell infiltration 呈正相關;免疫細胞以既有 leukocyte markers 定義,包括 PTPRC、CD3E、CD4、CD8A、CD14、CD68、LYZ、ITGAX。

這使 p21+ senotype 的意義更加清楚:它不只是 β 細胞本身功能較差,也可能透過促發炎 SASP 改變胰島微環境,吸引或伴隨更多免疫細胞浸潤,形成更病理性的局部狀態。

空間分布補充分析將胰臟區域分成 islet、gamma-enriched islet、acinar-islet border、acinar、duct/vasculature、immune、mesenchymal、ductal metaplasia、inflamed/stress acinar 等 anatomical neighborhoods,並比較一般 β cells 與 p21+ β cells 對 ductal cells、endothelial cells 的 neighborhood Z-score。這類 spatial interactome 分析為理解 senotype 如何嵌入局部組織微環境提供基礎。

工作模型:p16/CDKN2A 可能代表適應性生理衰老;p21/CDKN1A 可能代表失適應性病理衰老

綜合 transcriptome、spatial proteomics、spatial transcriptomics、functional assays 與 SASP/immune infiltration 分析,目前工作模型如下:

在人類胰臟中,隨年齡增加,至少有兩類主要 senotype 上升:

  1. p16INK4A / CDKN2A senotype

    • 隨年齡增加
    • β 細胞身分相對保留
    • 胰島功能相對保留
    • immune infiltration 較低
    • 可能代表 adaptive / physiological senescence
  2. p21CIP1 / CDKN1A senotype

    • 隨年齡增加
    • β 細胞身分下降
    • glucose responsiveness 與 insulin secretion 受損
    • immune infiltration 較高
    • 可能代表 maladaptive / pathological senescence

double-positive population 則較複雜:它在某些方面接近 p16+ senotype,在另一些方面接近 p21+ senotype。也就是說,senotype 並非只有單一路徑,而可能代表不同衰老程式的交會點。

整體研究目標是建立 human endocrine pancreas 的 senotype blueprint,揭示不同衰老 signature 的生物意義,並為未來 senotherapeutic strategies 在代謝健康與整體人類健康上的應用提供依據。

致謝與研究網絡

本研究特別感謝器官與組織 donor 及其家屬,因為這類人類胰臟研究高度仰賴珍貴 donor tissue。團隊也感謝 Joslin lab 成員、bioinformatics core、SenNet Tissue Mapping Center 團隊,以及多個合作單位。

致謝名單包含 Joslin Diabetes Center 的 Maya Jackson、Christopher Cahill、Sandra Le、Adedoyin Adebayo、Priscila Carapeto、Francesko Hela、Susan Bonner-Weir、Jennifer Hollister-Lock;Joslin Bioinformatics core 的 Pan Hui、Jonathan Dreyfuss;The Jackson Laboratory、UT Health San Antonio、Cedars-Sinai Medical Center、Mayo Clinic、Johns Hopkins University、Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute、University of Connecticut 等合作團隊。資助來源包括 NIH / NIDDK R01 DK132535、NIH 1U54AG075941、Joslin Margaret A. Congleton Chair、Manpei Suzuki Diabetes Foundation、The Iacocca Family Foundation,以及 IIDP、PRODO Laboratories 等資源。

討論與問答:p21、p16 與雙陽性族群之間的關係

第一個問題聚焦在一個很有趣的觀察:只有 p21+ group 出現明顯 β-cell marker genes 下調;但 double-positive cells 雖同時表現 p21 與 p16,卻沒有同樣明顯的 β 細胞身分喪失。問題是:這兩個衰老路徑之間的互動如何理解?double-positive cells 究竟代表什麼?

回答指出,double-positive subpopulation 會依照觀察的 phenotype dimension 不同,而與 p21 或 p16 各自共享部分特徵。若看 β-cell identity,double-positive cells 比較像 p16+ cells,也就是不會像 p21+ cells 那樣明顯喪失 β 細胞身分;但若看 secretome 或 SASP,double-positive cells 則比較像 p21+ subpopulation,偏向 pro-inflammatory。

不過,double-positive cells 在數量上很少。整體而言,主要 senescent population 仍以 p21+ phenotype 為主,因此本研究的病理性解讀主要圍繞 p21+ cells。

第二個問題詢問這些族群到底佔多少比例,也就是 senescent subpopulations 在細胞數量上有多大。回答強調:比例高度依賴平台與樣本處理方式。

若看 single-cell RNA-seq,在年輕 donor 中 senescent subpopulation 可高達約 20%,這個比例相當高;但若看不經過組織解離、保留空間架構的 spatial data,比例會降到約 5% 的 β cells。跨平台來看,在 β 細胞中主要 senotype 是 p21 phenotype,約可佔 senescent β-cell phenotypes 的 40% 左右;其他族群比例更低。不同 endocrine cell types 也各自有不同 senotype proportions。

由於時間限制,問答在此暫停,場次繼續下一場演講。

Take-home Summary

  • 人類內分泌胰臟的衰老不是單一狀態,而是可分成不同 senotypes。
  • 本研究以 CDKN1A/p21CDKN2A/p16 區分至少兩個主要衰老表型,並另有少量 double-positive population。
  • 隨年齡增加,β 細胞比例、insulin 與 C-peptide 下降;CDKN1A、CDKN2A 與胰島形態不規則性上升。
  • p21+ β cells 具有 β-cell identity loss、insulin/C-peptide/MAFA 下降、glucose responsiveness 受損、促發炎 SASP 與較高 immune infiltration,較符合 maladaptive / pathological senescence
  • p16+ β cells 則保留 β-cell identity 與功能,immune infiltration 較低,可能代表 adaptive / physiological senescence
  • double-positive cells 在 identity 上較像 p16+ cells,但在 secretome 上較像 p21+ cells;比例較低。
  • 若未來要發展 senotherapeutics,重點不只是「清除衰老細胞」,而是要辨識並精準靶向真正病理性的 senotype,同時避免破壞可能具有保護性或適應性功能的衰老族群。
Senotype Blueprint of the Human Endocrine Pancreas