Optimizing Diet for Global Diabetes Prevention Leveraging Proteomics and AI
利用蛋白質組學與人工智慧優化全球飲食以預防糖尿病
1. 簡介與全球飲食不理想對糖尿病的影響
本場演講由哈佛醫學院及布萊根婦女醫院(Brigham and Women's Hospital)醫學導師、Channing 網路醫學部及遺傳學部研究員 Tinashe Chikowore 博士主講。其研究核心在於將遺傳學、多體學(omics)和機器學習應用於以營養為基礎的複雜疾病研究,特別是針對非洲人群。
近年來,各大新聞媒體開始高度關注飲食與糖尿病之間的關聯。這一波討論源自於一項涵蓋全球 184 個國家、跨越 1990 年至 2018 年的關鍵性大型研究。該研究指出,高達 70% 的新發第 2 型糖尿病(incident type 2 diabetes)病例與「不理想的飲食」(suboptimal diets)密切相關。因此,如何在全球範圍內優化飲食以預防糖尿病,已成為當前公共衛生領域的重要課題。
Slides 延伸補充:
- [Slide 76-79] 演講者提及的關鍵研究發表於知名期刊 Nature Medicine(2023 年 4 月 17 日線上發表,標題為 "Incident type 2 diabetes associated with suboptimal diet in 184 countries",第一作者為 Meghan O'Hearn 等人)。該文章引發了學術界與公眾的廣泛討論,截至投影片製作時已累積超過 10 萬次的訪問量。
2. 全球飲食多樣性與傳統評估指標的侷限性
在世界地圖上,推動全球飲食優化並非一項簡單的任務。飲食(diet)具有高度的文化性(cultural)、動態性(dynamic)與多樣性(diverse),不同地區的人們攝取的食物種類千差萬別。
現行的飲食質量評估指標(diet quality metrics,如 DASH 飲食、地中海飲食評分、AHEI 等)多數是由西方/歐洲學術機構所制定,並非基於全球人口的多樣化飲食數據。因此,這些指標往往過度強調某些在非西方國家並不普遍攝取的食物。例如,指標中常將「優格(yogurt)攝取量不足」列為糖尿病風險因素之一,然而世界上許多地區的居民在日常生活中根本沒有食用優格的習慣。
Slides 延伸補充:
- [Slide 80] 展示了 TasteAtlas 互動式世界美食地圖,呈現全球各洲截然不同的飲食文化與地方特色美食(如北美與歐洲的起司堡、披薩,對比非洲的 Waakye、Suya 等),突顯全球食物的多樣化。
- [Slide 81-83] 引用了 2022 年發表於 Nature Food 的研究 "Global dietary quality in 2018 show wide disparities by region and urbanicity"(作者為 Victoria Miller 等)。該研究分析指出,全球飲食質量在年齡、性別、收入和城市化程度上存在巨大差異。
- [Slide 83 的圖表] 進一步剖析各項飲食因素對糖尿病風險的相對影響大小。在不理想的飲食中,主要風險因子包括:全穀物(whole grains)攝取不足、精製穀物(refined grains)攝取過多、加工肉類(processed meats)和未加工紅肉(unprocessed red meat)攝取過多,以及優格(yogurt)攝取不足等。
3. 蛋白質組學(Proteomics)作為通用評估工具
由於不同文化背景下的具體食物差異極大,研究人員開始探索一種新的視角:觀測人體的蛋白質組(proteome),研究食物如何調節我們體內的蛋白質表達。
在坦尚尼亞進行的一項隨機對照臨床試驗(RCT)中,研究人員評估了當地居民日常攝取的食物,並對比了「非洲傳統飲食(African Heritage Diet, AHD)」與西方飲食(Western Diet, WD)對人體的影響。實驗結果顯示,當參與者從西方飲食切換回非洲傳統飲食,僅在短短兩週內,其與發炎(inflammation)和心血管代謝(cardiometabolism)相關的蛋白質組學特徵(proteomic profiles)就發生了顯著改善。
這證明了一個觀點:「吃得健康」是宇宙通用的規律(universal),但具體的飲食結構並非一成不變(not uniform)。
Slides 延伸補充:
- [Slide 84-85] 該隨機對照臨床試驗發表於 Nature Medicine,題為 "Immune and metabolic effects of African heritage diets versus Western diets in a randomized controlled trial"。
- [Slide 85] 詳述了該研究的臨床設計:
- 對象分為習慣食用非洲傳統飲食(Habitual AHD)的鄉村居民,與習慣食用西方飲食(Habitual WD)的城市居民。
- 進行為期 2 週的交叉飲食干預(包含傳統發酵香蕉飲料的補充),並於 (起點)、(1-2 週後)、(4 週後)收集樣本。
- 檢測指標涵盖了血球計數(Hemocytometry)、細胞激素產生(Cytokine production)、血漿蛋白質組(Plasma proteome)、血漿代謝組(Plasma metabolome)及全血轉錄組(Whole-blood transcriptome),分析其發炎因子與生長因子。
4. 營養素模式(Nutrient Patterns)的推導與跨人群驗證
雖然人們吃的是不同的具體食物,但這些食物都共享著通用的營養素(nutrients)。如果將這些營養素進行合理的聚類,就能捕捉到獨特的「營養素模式」(nutrient patterns)。
Dr. Chikowore 的研究團隊提出假設:如果將這些營養素模式與蛋白質組學相結合,所得到的蛋白質組學特徵是否具備跨人群的普遍性(generalizable),從而幫助我們界定哪些營養素模式具有保護性?
為了驗證這一假設,研究團隊設計了以下研究方案:
- 推導營養素模式: 在非洲人群世代(African cohort)中衍生出特定的營養素模式。
- 結合蛋白質組特徵: 利用彈性網路(Elastic Net, EN)機器學習模型,篩選出與這些營養素模式高度相關的血漿蛋白質組學特徵(基於 Olink 心血管疾病面板 I & II)。
- 跨人群驗證: 利用大規模的英國生物樣本庫(UK Biobank)多族裔數據,驗證這些蛋白質組學特徵的普適性,並分析其代表的生物學途徑。
在分析中,以非洲飲食特徵為代表的「植物驅動營養素模式」(plant-driven nutrient pattern)脫穎而出。研究發現,該模式與 瘦素(Leptin, LEP) 等發炎/代謝相關蛋白的減少顯著相關。
令人振奮的是,當研究團隊在 UK Biobank 的多族裔樣本中進行驗證時,發現該蛋白質組學特徵具有極高的泛化能力。在所有不同族裔的人群中,此一特徵均與 BMI 降低、高密度脂蛋白膽固醇(HDL)升高,以及空腹血糖(fasting glucose)降低 密切相關。非洲發現世代(African discovery cohort)與多族裔 UK Biobank 之間的效應量(effect sizes)展現出高度的一致與相關性。
Slides 延伸補充:
- [Slide 86-89] 點出核心問題在於缺乏一個通用的飲食質量度量標準。研究團隊利用雷達圖(Radar chart)分析了 PC1(主成分 1)、PC2、PC3 在基線與追蹤期(baseline & followup)的營養素密度與穩定生物標誌物組合,發現不同的營養素模式能呈現出相當穩定的軌跡。
- [Slide 90] 詳述了初步分析的設計流程圖。Elastic Net 模型在 N = 1000 的樣本中進行訓練(80% 作為訓練集,20% 作為測試集),用以預測特定的營養素模式。
- [Slide 91-94] 雷達圖中包含 25 種關鍵營養素(如植物蛋白、動物蛋白、飽和脂肪、澱粉、多種維生素及礦物質等)。在植物驅動模式中,植物蛋白、澱粉、鋅、維生素 B6 與葉酸表現出較高的正向標準化值。
- [Slide 92] 的棒棒糖圖(Lollipop chart)展示了與此模式關聯最顯著的 25 個蛋白標誌物,包含 LEP(瘦素,呈現明顯負相關)、ADM、PAI 等。
- [Slide 95-96] 展示了將「原始營養素/飲食量」(紅點)與「推薦營養素/飲食量」(藍點)進行優化的對比。在優化後,能在不劇烈改變總飲食量的前提下,將各項營養素指標拉向健康推薦值。
- [Slide 97] 總結數據到模式的分析管線(Data to Patterns Pipeline):食物頻率問卷(FFQ) 主成分分析(PCA)得到營養素模式 建立具保護性的營養素蛋白質特徵 跨族裔通用性驗證。
5. 人工智慧(AI)與文化敏感性飲食 App 的開發
然而,醫學與營養學研究面臨的另一個現實是:人們吃的是「食物」(food),而不是單純的「營養素」(nutrients)。 如何從抽象的營養素模式跨越到實體食物?
這正是人工智慧(AI)大顯身手的領域。研究團隊目前正在開發一套涵蓋全球多國食物的「多樣化食物成分表」(diverse food composition table)。
其運作機制如下:
- 用戶輸入: AI 算法首先會詢問用戶在日常生活中習慣吃哪些文化背景的食物(what they usually eat)。
- 算法優化: 在獲取用戶的飲食習慣後,演算法會在不破壞其文化飲食習慣的前提下,進行智能優化與微調,使其營養素構成最大程度地匹配具有保護性的「健康營養素模式」。
- 移動端落地: 為了讓這項研究能夠真正造福大眾並實現規模化(scale),研究團隊規劃將這些經 AI 優化的糖尿病防護飲食模式,整合解碼到一款移動應用程序(Mobile App)中。
這套解決方案的終極目標,是讓不同地區的用戶能夠充滿信心地使用日常可及、符合個人文化背景且可負擔的在地食物,同時在不知不覺中優化膳食結構,從而有效降低第 2 型糖尿病的發生風險。
Slides 延伸補充:
- [Slide 98] 繪製了移動端 App 的運行流程:
- 用戶輸入(結合全球地圖、心血管健康與食物偏好)。
- 輸出個性化飲食推薦(Personalized dietary recommendations,以均衡飲食餐盤及目標指引呈現)。
- 最終實現「健康飲食模式 降低糖尿病風險(更好的血糖管理)」的預防醫學目標。
- [Slide 99] 致謝合作者與博士後研究員:哈佛醫學院的 Xuwen Wang 導師、Giulia Menichetti 助理教授、Shilpa Bhupiraju 助理教授,以及博士後研究員 Yann Ilboudo。
二、大會總結與 Pathway 項目介紹
在 Dr. Chikowore 結束演講後,大會主席對今日 Pathway Symposia 發表的所有學者(Dr. Iver, Dr. Heffler, Dr. Chikowore)致以誠摯的謝意,讚揚他們大膽的創新思維、跨學科協作精神,為糖尿病預防與治療注入了新的生命力。
大會進一步向與會者介紹了美國糖尿病協會(ADA)對支持創新科研的長期承諾與資源:
- ADA 期刊專欄: 鼓勵大家關注《Diabetes》期刊中的 "Pathway to Stop Diabetes" 專欄,其中收錄了歷屆獲獎學者的最新研究報告。
- 歷史影音資源: 可在 ADA 科研規劃官方網站觀看往屆 Pathway 研討會的錄影,追蹤該社群科研理念的演進。
- 青年學者基金支持: 大會特別強調了 ADA 對早期職業研究人員(early career investigators)的扶持。許多如今的學術領袖,其科研生涯的第一筆資金正是來自於 ADA 的青年科學家資助計劃,這些早期投資成功孵化了諸多改變領域格局的科學發現。
Slides 延伸補充:
- [Slide 100-101] 介紹了 Diabetes 期刊中的 "Pathway to Stop Diabetes Collection"。該計劃提供 5 到 7 年的持續資金支持,給予科學家充足的自由度去追求大膽的構想,免受傳統項目制資金的束縛。
- [Slide 102] 展示了線上平台,可點播觀看 2023 年與 2024 年 Pathway 研討會的精采成果報告。
- [Slide 103] 羅列了當前及即將開放的 ADA 基金申請機會:
- Type 1 Diabetes RFA (2026): 意向書(LOI)截止日期為 2026 年 4 月 28 日,完整申請截止日期為 2026 年 6 月 24 日。
- Pathway to Stop Diabetes—2026: 截止日期為 2026 年 5 月 19 日。
- Postdoctoral Fellowship Awards—2026: 截止日期為 2026 年 4 月 30 日。
- 基於初級照護環境優化糖尿病預防與照護的創新研究基金: 意向書截止日期為 2025 年 12 月 4 日,完整申請截止日期為 2026 年 2 月 19 日。
- [Slide 105] 大會小插曲:宣傳大會現場受歡迎的 "Puppy Park" 互動區(位於 1645 號展位)。
- [Slide 106] 邀請與會者參與「糖尿病餐盤調查(Diabetes Plate Survey)」,收集患者、教育者及醫護專業人員的意見,以優化和更新推廣已久的糖尿病飲食指南圖示(將餐盤劃分為 50% 非澱粉類蔬菜、25% 碳水化合物食品、25% 蛋白質食品)。
三、Slides 補強索引
以下為投影片內容與前文筆記段落的對應關係:
- Slide 75: 講師背景介紹(對應「1. 簡介與全球飲食不理想對糖尿病的影響」)
- Slide 76-79: 184 國飲食與糖尿病關聯研究(對應「1. 簡介與全球飲食不理想對糖尿病的影響」)
- Slide 80: 全球食物地圖多樣性(對應「2. 全球飲食多樣性與傳統評估指標的侷限性」)
- Slide 81-83: 全球飲食質量 disparities 研究及飲食危險因子排名(對應「2. 全球飲食多樣性與傳統評估指標的侷限性」)
- Slide 84-85: 坦尚尼亞傳統與西方飲食 RCT 的研究設計與多體學檢測(對應「3. 蛋白質組學(Proteomics)作為通用評估工具」)
- Slide 86-89: 飲食指標缺失與營養素主成分分析之穩定度雷達圖(對應「4. 營養素模式(Nutrient Patterns)的推導與跨人群驗證」)
- Slide 90: 機器學習 Elastic Net 預測流程圖(對應「4. 營養素模式(Nutrient Patterns)的推導與跨人群驗證」)
- Slide 91-94: 25 種營養素雷達圖及 25 種關聯蛋白棒棒糖圖(對應「4. 營養素模式(Nutrient Patterns)的推導與跨人群驗證」)
- Slide 95-96: 原始飲食與優化飲食之營養素 dumbbell 對比圖(對應「4. 營養素模式(Nutrient Patterns)的推導與跨人群驗證」)
- Slide 97: 數據至特徵分析管線圖(對應「4. 營養素模式(Nutrient Patterns)的推導與跨人群驗證」)
- Slide 98: 行動應用程式(App)運行原理與預期健康改善成效(對應「5. 人工智慧(AI)與文化敏感性飲食 App 的開發」)
- Slide 99: 研究團隊與致謝名單(對應「5. 人工智慧(AI)與文化敏感性飲食 App 的開發」)
- Slide 100-104: ADA Pathway 項目、期刊特輯、往屆點播與 2025/2026 基金資助時程表(對應「二、大會總結與 Pathway 項目介紹」)
- Slide 105-106: 大會 Puppy Park 與 Diabetes Plate 實務問卷推廣(對應「二、大會總結與 Pathway 項目介紹」)
